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西南大学科研团队绘就家蚕超级泛基因组图谱

所属分类:时事聚焦    发布时间: 2022-10-11    作者:
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中国教育报-中国教育新闻网讯(记者 胡航宇)10月9日,西南大学发布*新科研成果,家蚕基因组生物学国家重点实验室团队历时四年,完成家蚕大规模种质资源基因组解析(“千蚕基因组”),绘就家蚕超级泛基因组图谱。该研究在世界上率先实现家蚕基因库数字化,创建“数字家蚕”,对于深化功能基因组研究和推进家蚕模式化,开启家蚕设计育种,赋能“改造家蚕、多元利用”等,将产生深远的影响。

家蚕是重要的经济昆虫和新兴模式生物,但之前仅有单一参考基因组及部分重测序,尚不足以支撑基因组变异和优良基因的深度挖掘。家蚕基因组生物学国家重点实验室主任、国家蚕桑产业技术体系首席科学家代方银教授介绍,研究团队对1078份蚕种质资源(205份地方种,194份改良种,632份遗传材料,47份野桑蚕)进行了深度测序,产生55.57T基因组数据,组装了545个蚕的高质量基因组,对100个基因组进行了基因注释,鉴定到4300余万个SNP、930余万个InDel、340余万个结构变异(SV)和7308个新基因(家族),绘制了一个高精度家蚕泛基因组图谱。

该超级泛基因组囊括了目前*全面的家蚕和野桑蚕基因组信息,是迄今全球动植物领域*大的长读长泛基因组。同时,对蚕的各种遗传变异、群体结构、人工选择和生态适应性及经济性状开展了深入的研究,取得丰硕的创新结果。其研究论文于今年9月24日在国际名刊《自然通信》(Nature Communications)在线发表。

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